97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0956 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  47.1 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 306 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  39.84 
 
 		 311 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  44.36 
 
 		 274 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  39.1 
 
 		 135 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  37.21 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  37.59 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  37.14 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  39.69 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  39.69 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  39.69 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  37.69 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  34.75 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  34.35 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  36.54 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  29.79 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  31.21 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  41.07 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  34.53 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  26.7 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  32.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  30.95 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  30.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  28.93 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  27.66 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  30.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  31.01 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  28.12 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  29.27 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  26.95 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  31.14 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  26.19 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  28.97 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  29.27 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0372  hypothetical protein  34.41 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2498  hypothetical protein  37.18 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  30.23 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  31.68 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1823  hypothetical protein  31.36 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00900716  normal  0.0800566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  40.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  28.3 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  28.3 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  33.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  34.04 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.03 
 
 		 122 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 284 aa  41.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  32.11 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2593  hypothetical protein  36.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000321812  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1279  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.03 
 
 		 127 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.381542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>