83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1823 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1823  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00900716  normal  0.0800566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0372  hypothetical protein  62.24 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0176  hypothetical protein  56.46 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  34.03 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  37.14 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  30.88 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  36.54 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  31.13 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  31.13 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  35.11 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  32.17 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  37.69 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  35.94 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  30.37 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  37.8 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  30.83 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  30.83 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  31.91 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  35.48 
 
 
311 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  39.68 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  43.69 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  31.06 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  30.83 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1973  hypothetical protein  60.78 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  32.69 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  36.97 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  28.03 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  34.45 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  31.3 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  38.26 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  30.25 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  30.83 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  38.39 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  30.4 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  31.16 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  32.14 
 
 
157 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  34.11 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  32.41 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  24.63 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 
274 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  37.84 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0862  hypothetical protein  34.86 
 
 
202 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.929714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  29.52 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  32.56 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  29.91 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  29.71 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  36.47 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  30.28 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  29.89 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  26.4 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  31.36 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4145  hypothetical protein  34.57 
 
 
202 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  29.87 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  29.87 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  29.87 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  31.91 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  29.77 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  30.56 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  28.71 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2498  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  28.71 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  31.19 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  28.71 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  29.73 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  27.88 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  27.88 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  30.48 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  27.88 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>