114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4211 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  85.19 
 
 		 135 aa  244  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  54.55 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  49.25 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  48.51 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  44.03 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  50.39 
 
 		 311 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  48.09 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  48.09 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  48.09 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  47.52 
 
 		 177 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  48.51 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  48.12 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  47.33 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  47.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  47.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  47.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.97 
 
 		 306 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  42.74 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.21 
 
 		 274 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  41.98 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  43.41 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  39.67 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  39.67 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  39.67 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  41.22 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  37.3 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  38.35 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  39.52 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  41.54 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  39.69 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  39.69 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  39.86 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  40.46 
 
 		 360 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  38.21 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  37.98 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  40.6 
 
 		 169 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  38.64 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  39.1 
 
 		 161 aa  94.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  32.4 
 
 		 196 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  36.64 
 
 		 324 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  38.76 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  39.1 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  38.58 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  35.66 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  32.56 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  38.71 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  30.53 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  37.4 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  38.71 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  38.71 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  36.29 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  37.29 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  37.4 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.1 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  38.64 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  32.61 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  41.09 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  36.43 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  34.35 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  38.05 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  37.82 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  37.82 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  37.82 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  33.6 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  36.44 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  37.38 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  33.07 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  34.68 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  34.68 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  34.68 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  35.25 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  32.8 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  33.94 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  35.34 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  35.2 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0055  hypothetical protein  36.9 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  34.68 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  32.52 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  33.96 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>