22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2593 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2593  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  320  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000321812  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0980  hypothetical protein  49.3 
 
 
158 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0458  hypothetical protein  51.03 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0469  hypothetical protein  51.03 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0445  hypothetical protein  50.34 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1106  hypothetical protein  45.64 
 
 
171 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.721892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1115  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1545  hypothetical protein  43.54 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  32.65 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1971  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1899  hypothetical protein  47.17 
 
 
130 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  27.43 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  27.43 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  35.19 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  45.28 
 
 
128 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  45.28 
 
 
128 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  45.28 
 
 
128 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  26.55 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  36.92 
 
 
311 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  36.46 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>