13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1545 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1545  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  344  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0980  hypothetical protein  44.52 
 
 
158 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1106  hypothetical protein  48.67 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.721892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1115  hypothetical protein  47.75 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2593  hypothetical protein  43.54 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000321812  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0458  hypothetical protein  46.09 
 
 
158 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0469  hypothetical protein  46.09 
 
 
158 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0445  hypothetical protein  45.22 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  31.36 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  31.36 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  30.18 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  35.64 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  29.84 
 
 
119 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>