21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1106 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1106  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  343  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.721892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2593  hypothetical protein  45.64 
 
 
164 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000321812  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0980  hypothetical protein  41.72 
 
 
158 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1115  hypothetical protein  45.58 
 
 
166 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0445  hypothetical protein  44.37 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0458  hypothetical protein  43.71 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0469  hypothetical protein  43.71 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1545  hypothetical protein  47.75 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  34.96 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  34.96 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  34.58 
 
 
159 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  37.38 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  37 
 
 
157 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  35.05 
 
 
151 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  35.82 
 
 
119 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0055  hypothetical protein  28.68 
 
 
117 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>