18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3261 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  39.88 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  41.67 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02853  hypothetical protein  27.2 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  32.29 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 319 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  28.17 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  29.53 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  24.14 
 
 		 141 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  26.39 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 		 152 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>