16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1118 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  53.78 
 
 
132 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  49.17 
 
 
128 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  44.35 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  41.27 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  43.1 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  44.95 
 
 
191 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  42.24 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  42.24 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  38.6 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  38.6 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  43.59 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  24.81 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22710  hypothetical protein  34.21 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  24.14 
 
 
165 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>