26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0145 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  263  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  263  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  97.73 
 
 
135 aa  260  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  59.84 
 
 
126 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  57.38 
 
 
128 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  47.83 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  42.24 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  42.62 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  38.66 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  36.59 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  34.74 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  35.21 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  33.07 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  31.86 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  28.7 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  37.76 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  42  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.85 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
146 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22710  hypothetical protein  34.96 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  31.68 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  28.12 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>