17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2710 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  52.38 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  49.53 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  51.3 
 
 
132 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  45.13 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  47.86 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  49.51 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  40.17 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  38.66 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  38.66 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  38.66 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  29.06 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  28.87 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22710  hypothetical protein  42.25 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  32.04 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
319 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>