19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2322 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  256  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  50.76 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  50.4 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  50.43 
 
 
118 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  52.99 
 
 
154 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  47.9 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  48.31 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  48.31 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  48.65 
 
 
191 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  42.11 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  40.71 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  38.79 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  38.89 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  35.04 
 
 
140 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  32.35 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  51.72 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  40  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>