16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1545 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  49.53 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  50.41 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  44.35 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  44.14 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  42.15 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  40.8 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  37.3 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  36.59 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  36.59 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  38.05 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  34.19 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  34.82 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  37.35 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  32.35 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>