15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2148 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2148  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  304  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  53.85 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  42.06 
 
 
141 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  48.18 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  44.72 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  44.72 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  43.09 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1424  hypothetical protein  45 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  40.8 
 
 
140 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  45.13 
 
 
128 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  42.15 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  39.66 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  27.88 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  32.32 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>