22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0842 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  339  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  60.13 
 
 
163 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  34.03 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  32.88 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  32.61 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  29.2 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  26.57 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  26.57 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  31.03 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  26.06 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  26.06 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  26.06 
 
 
155 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  26.06 
 
 
159 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02853  hypothetical protein  22.76 
 
 
160 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  24.79 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  26.79 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3644  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0467611  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7124  hypothetical protein  33.01 
 
 
139 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>