39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2430 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  333  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  333  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  93.71 
 
 		 159 aa  313  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  94.81 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  95.14 
 
 		 164 aa  285  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  95.14 
 
 		 166 aa  285  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  49.65 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  46.67 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 319 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  41.84 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  32.62 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  35.17 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  41.82 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  33.54 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  26.9 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  26.9 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  30.5 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  30.71 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  30.71 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.41 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  37.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  24.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2368  hypothetical protein  24.14 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  23.36 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  24.11 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  26.57 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  27.42 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  22.63 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  27.19 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>