40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2201 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  288  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  49.01 
 
 
157 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  27.46 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  27.46 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  31.91 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  27.86 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  26.9 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  26.9 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  32.35 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  28.67 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  30.15 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  25.9 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  25.18 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  26.23 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  27.41 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  25.93 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 
319 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  28.7 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  25.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  27.63 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  21.77 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  32.5 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  31.51 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  23.42 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  25.69 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.06 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  23.31 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  42.22 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  42.22 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  42.22 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  25.93 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  32.1 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.26 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  27.14 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>