25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0293 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  84.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  84.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  34.56 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  34.56 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  35.97 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  30.56 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  29.86 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
319 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  26.23 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  25.41 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  28.03 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  26.28 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  28.26 
 
 
157 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.17 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  27.48 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  23.45 
 
 
147 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 
185 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  21.62 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  24.26 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>