17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2303 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  40.15 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  36.69 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  37.16 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  37.16 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  37.59 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  37.59 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  34.93 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  35.46 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  35.17 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.64 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  32.46 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  33.93 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  28.06 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  29.93 
 
 
169 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  27.03 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>