43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3537 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  47.55 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  45.64 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  45.83 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  45.83 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  47.06 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  48.59 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  42.72 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 
319 aa  87.8  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  35 
 
 
162 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  40.54 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  40.15 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  31.88 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  31.85 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  32.41 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  27.54 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  32.89 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  33.78 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.37 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  29.11 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  29.87 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2581  hypothetical protein  33.04 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  35.17 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  29.79 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  25.69 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  33.93 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  31.03 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3328  hypothetical protein  28.68 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311727  hitchhiker  0.00221745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.82 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  51.72 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  27.94 
 
 
165 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>