28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3350 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  323  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  33.1 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  33.1 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  33.1 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  31.72 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  31.72 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  30.34 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  31.88 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  31.47 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  27.61 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  29.5 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  25.35 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.79 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  26.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  20.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  19.58 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  32.05 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  36.21 
 
 		 257 aa  40.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>