41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2581 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  536  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  28.76 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  27.44 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2363  lipid-binding START domain-containing protein  27.6 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000024252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0217  lipid-binding START domain-containing protein  28 
 
 		 345 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2339  lipid-binding START domain-containing protein  25 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  26.34 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  27.62 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3079  lipid-binding START domain-containing protein  30.65 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000582809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1609  hypothetical protein  26.34 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  26.13 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  24.3 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2003  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  26.27 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2193  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3105  hypothetical protein  26.29 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.112367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  24.88 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  26.42 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  23.86 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  26.6 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  24.47 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1402  cyclase/dehydrase  25.15 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0962  hypothetical protein  26.38 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.267606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  23.46 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  23.53 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  25.39 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  23.01 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  25.15 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0812  hypothetical protein  27.22 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00891451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  25.44 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  21.9 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2688  hypothetical protein  22.51 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  24.87 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1528  cyclase/dehydrase  24.43 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.116522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  24.61 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0963  hypothetical protein  20.62 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0932089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  23.96 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1289  hypothetical protein  19.69 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.168956  normal  0.768265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1012  hypothetical protein  20.3 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0651821  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1401  hypothetical protein  19.27 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00493081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>