29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0350 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  24.86 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_93506  predicted protein  27.46 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144951  normal  0.0621668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  26.99 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  27.88 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  23.08 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  26.11 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  24.24 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  26.06 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  24.42 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  27.49 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  24.24 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  24.22 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  24.75 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  24.24 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  24.85 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2339  lipid-binding START domain-containing protein  26.53 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  24.68 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  26.82 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  23.94 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  23.66 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  22.6 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  25.7 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  26.26 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  27.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  24.4 
 
 		 338 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>