45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1496 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1402  cyclase/dehydrase  81.57 
 
 		 218 aa  380  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1528  cyclase/dehydrase  80.18 
 
 		 218 aa  381  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.116522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0812  hypothetical protein  76.15 
 
 		 220 aa  364  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00891451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0962  hypothetical protein  75.12 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.267606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  73.15 
 
 		 218 aa  341  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  69.91 
 
 		 220 aa  328  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1012  hypothetical protein  29.51 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0651821  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1401  hypothetical protein  33.15 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00493081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2003  hypothetical protein  33.71 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0963  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0932089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1527  hypothetical protein  29.79 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0659777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  30.11 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  31.32 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1495  hypothetical protein  27.46 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  30.23 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  28.74 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  27.75 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  32.75 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  28.49 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  28.24 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  28.82 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  28.81 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2339  lipid-binding START domain-containing protein  27.17 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  27.91 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  28.81 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1289  hypothetical protein  22.8 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.168956  normal  0.768265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  28.24 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  27.68 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2363  lipid-binding START domain-containing protein  27.62 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000024252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  27.12 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  28.27 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3079  lipid-binding START domain-containing protein  23.27 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000582809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3105  hypothetical protein  24.72 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.112367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  27.01 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  28.67 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0811  hypothetical protein  25.13 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00425843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  27.37 
 
 		 338 aa  71.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2688  hypothetical protein  29.05 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1609  hypothetical protein  22.95 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0217  lipid-binding START domain-containing protein  21.91 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  23.46 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  24.22 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2910  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.824331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>