14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2910 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.824331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  24.26 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  18.66 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  20.11 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1402  cyclase/dehydrase  27.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0449379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  20.48 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  22.62 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  21.4 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1528  cyclase/dehydrase  27.98 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.116522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  20.77 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  23.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  22.98 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  23.16 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>