46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001080 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  32.95 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2910  hypothetical protein  32.8 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.824331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  27.27 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2363  lipid-binding START domain-containing protein  28.26 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000024252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  26.92 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  30.46 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  27.08 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  26.87 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  26.37 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  28.48 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1402  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1528  cyclase/dehydrase  30.46 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.116522  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0962  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.267606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  27.66 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1289  hypothetical protein  24.86 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.168956  normal  0.768265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  26.59 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  24.5 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  24.88 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  26.83 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  27.49 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1495  hypothetical protein  24.86 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  26.32 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0812  hypothetical protein  29.25 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00891451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  25.71 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2003  hypothetical protein  29.08 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1012  hypothetical protein  24 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0651821  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1401  hypothetical protein  22.16 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00493081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1527  hypothetical protein  21.59 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0659777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  25.29 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3105  hypothetical protein  22.22 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.112367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2193  hypothetical protein  24.76 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  24.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0963  hypothetical protein  22.4 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0932089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3079  lipid-binding START domain-containing protein  25.39 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000582809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  23.7 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0811  hypothetical protein  25.78 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00425843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  26.34 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0217  lipid-binding START domain-containing protein  21.29 
 
 		 345 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00460  hypothetical protein  25.86 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1609  hypothetical protein  26.17 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2339  lipid-binding START domain-containing protein  22.04 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>