29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2212 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  25.88 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  25.57 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  25.64 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  26.67 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  26.67 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  25.7 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2003  hypothetical protein  24.86 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2193  hypothetical protein  23.53 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  25.61 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  22.09 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  23.08 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  24.26 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  24.42 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  24.69 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  25.29 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  24.7 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  26.34 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  24.14 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  25.16 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  21.95 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  24.28 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_93506  predicted protein  23.11 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144951  normal  0.0621668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3079  lipid-binding START domain-containing protein  24.38 
 
 		 346 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000582809  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  21.94 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1495  hypothetical protein  22.29 
 
 		 212 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  22.7 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>