30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0790 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  44.05 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  41.72 
 
 
186 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 
188 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 
175 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  39.13 
 
 
187 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  39.88 
 
 
180 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  34.52 
 
 
185 aa  121  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  32.12 
 
 
218 aa  111  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  29.95 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  27.5 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  25.62 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  26.25 
 
 
174 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  21.79 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  28.46 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  24.53 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  24.37 
 
 
173 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  26.04 
 
 
175 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  30.71 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  23.62 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  24.79 
 
 
688 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  26.04 
 
 
146 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>