28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0504 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  65.45 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  61.9 
 
 		 175 aa  221  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  54.32 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  57.14 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  42.05 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  42.6 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  39.88 
 
 		 216 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  27.65 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  26.53 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  30.15 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  29.27 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  28.26 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  28.37 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  25.52 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  24.83 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  25.6 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  27.45 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  21.95 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  25.93 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  24 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  21.95 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>