33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0687 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  100 
 
 
185 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  53.11 
 
 
188 aa  208  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  54.32 
 
 
180 aa  204  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  52.66 
 
 
175 aa  191  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  51.23 
 
 
187 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  43.37 
 
 
186 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  39.34 
 
 
186 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  34.52 
 
 
216 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  34.91 
 
 
218 aa  115  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  29.93 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  29.91 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  26.21 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  26 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  28.91 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  26.87 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  27.21 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  26.87 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  25.5 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  26.62 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  25 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  24.34 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  23.81 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  25.53 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  21.37 
 
 
186 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>