28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0686 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  59.51 
 
 
186 aa  205  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  44.1 
 
 
175 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  42.61 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  42.05 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  43.71 
 
 
187 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  41.72 
 
 
216 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  39.34 
 
 
185 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  32.95 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  31.16 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  34.07 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  39.53 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  36.26 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  25.16 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  26.13 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  29.35 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  22.56 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
224 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  23.62 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  23.62 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  20.86 
 
 
322 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  23.66 
 
 
504 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  21.68 
 
 
147 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  19.23 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>