24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2052 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  29.27 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  24.49 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  23.87 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  23.94 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  22.07 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  27.48 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  22.62 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  27.41 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  25.2 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  20.55 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  22.88 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  22.22 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  24.44 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  25.74 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  22 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  22.76 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  23.88 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  23.85 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  22.79 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>