14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1874 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  32.62 
 
 
163 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  25.48 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  22.88 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  26.4 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  26.55 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  25.87 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  23.84 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  25.17 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  24.48 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  23.26 
 
 
174 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  21.77 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  23.08 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  25.64 
 
 
230 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>