30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0548 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  57.14 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  54.94 
 
 
188 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  53.16 
 
 
175 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  51.23 
 
 
185 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  48.45 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  43.71 
 
 
186 aa  150  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  39.13 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  36.25 
 
 
218 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  39.51 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  32.56 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  29.27 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  28.05 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  24.65 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  23.63 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  25.58 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  31.01 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  30.16 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  23.78 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  31.82 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  27.2 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  26.4 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  25 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  24.68 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  27.52 
 
 
688 aa  45.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  25.71 
 
 
322 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  27.19 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>