46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0982 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  44.87 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  44.83 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  42.47 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  35.67 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  37.76 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  35.81 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  37.76 
 
 		 180 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  41.38 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  38.3 
 
 		 173 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  32.56 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  28.18 
 
 		 322 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  34.38 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  28.24 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  28.46 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  24.29 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  25.6 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  21.54 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  22.27 
 
 		 504 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  23.38 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  22.62 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  25.2 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  28.45 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  27.5 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  23.67 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  27.59 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  25.58 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  24.03 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  24.03 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  26.6 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  24.03 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  26.6 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  24.81 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  24.75 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  26.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 144 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  23.26 
 
 		 148 aa  41.2  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  23.26 
 
 		 148 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>