30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1916 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  346  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  76.28 
 
 
174 aa  248  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  65.64 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  57.5 
 
 
173 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  55.62 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  55.77 
 
 
178 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  54.32 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  55.62 
 
 
180 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  40.61 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  40.52 
 
 
191 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  41.38 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  25.91 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  39.53 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  27.63 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  28.91 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  23.79 
 
 
504 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  28.37 
 
 
180 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  25.44 
 
 
218 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  31.01 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  29.46 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 
190 aa  57.8  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  28.33 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  27.01 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  24.37 
 
 
216 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  25.4 
 
 
688 aa  51.2  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  29.51 
 
 
185 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  21.48 
 
 
180 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  20.34 
 
 
144 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0340  cyclase/dehydrase  24.07 
 
 
148 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>