28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1930 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  65.45 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  63.64 
 
 
175 aa  226  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  53.11 
 
 
185 aa  208  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  54.94 
 
 
187 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  47.49 
 
 
186 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  42.61 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  35.88 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  43.29 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  30.07 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  28.05 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  25.38 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  30.77 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  30.66 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  27.7 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  25.33 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  25.87 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  25.19 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  25.19 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  26.98 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  23.95 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  29.2 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  25.2 
 
 
204 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  22.29 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  23.89 
 
 
186 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  23.29 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  21.12 
 
 
185 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>