33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09421 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  70.44 
 
 
174 aa  224  8e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  65.64 
 
 
173 aa  218  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  61.01 
 
 
173 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  51.59 
 
 
178 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  48.82 
 
 
175 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  50.32 
 
 
180 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  49.68 
 
 
179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  39.16 
 
 
202 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  42.47 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  38.93 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  28.04 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  29.91 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  25.62 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  29.27 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  26.17 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  28.9 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  29.23 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  25.16 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  29.13 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  24.79 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  27.42 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  27.2 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  27.41 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  25.32 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  23.01 
 
 
504 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  24.22 
 
 
688 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  22.58 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0340  cyclase/dehydrase  28.18 
 
 
148 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  25.2 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  26.73 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>