33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1938 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  41.46 
 
 
218 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  42.6 
 
 
180 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  43.29 
 
 
188 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  41.46 
 
 
175 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  40 
 
 
185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  37.5 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  39.51 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  33.53 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  32.93 
 
 
186 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  25.86 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  26.8 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  27.63 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  24.84 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  26.17 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  23.87 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  24.67 
 
 
173 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  24.29 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  29.87 
 
 
147 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  23.53 
 
 
175 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  25.43 
 
 
179 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  29.87 
 
 
147 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  25.44 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  22.09 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  21.95 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  24.67 
 
 
148 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  20.1 
 
 
322 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  23.2 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  24.82 
 
 
224 aa  42  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>