31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4456 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  100 
 
 
202 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  70.72 
 
 
191 aa  265  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  46.1 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  39.16 
 
 
195 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  40.61 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  39.87 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  38.22 
 
 
173 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  32.97 
 
 
178 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  32.26 
 
 
175 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  34.36 
 
 
179 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  32.96 
 
 
175 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  25.78 
 
 
322 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  27.39 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  34.07 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  25.38 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  26.21 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  24.46 
 
 
504 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  29.79 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  25 
 
 
218 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  20.55 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  25.76 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  24.68 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26 
 
 
147 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  24.07 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>