32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0750 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  72.09 
 
 
173 aa  251  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  68.86 
 
 
195 aa  230  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  58.55 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  51.83 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  52.87 
 
 
179 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  50.61 
 
 
175 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  52.5 
 
 
180 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  44.83 
 
 
204 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  39.61 
 
 
202 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  26.29 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  30.23 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  26.8 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  23.79 
 
 
504 aa  64.3  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  24.49 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  25.29 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  28.26 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  36.26 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  29.27 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  26.15 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  29.03 
 
 
186 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  22.77 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  22.77 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  23.81 
 
 
688 aa  44.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  22.45 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  22.56 
 
 
144 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  23.26 
 
 
180 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>