34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0842 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  41.46 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  35.88 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 180 aa  134  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 175 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  36.25 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  34.91 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  32.95 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  25.75 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  25.44 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  25.95 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  24.79 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  27.48 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  25.17 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  21.55 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  23.87 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  24.36 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  23.38 
 
 		 173 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  29.13 
 
 		 145 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  20.38 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  23.6 
 
 		 322 aa  48.5  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  20.71 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1697  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  26.55 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  23.97 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  25.22 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  24.83 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2552  cyclase/dehydrase  26.97 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00196411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28967  predicted protein  26.67 
 
 		 688 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0441407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>