23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0110 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  27.86 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  23.95 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  27.45 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  27.54 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  27.65 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  25.58 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  32.59 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  27.49 
 
 
230 aa  51.2  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  22.09 
 
 
218 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  25.32 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  23.81 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  20.71 
 
 
218 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  23.67 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  24.48 
 
 
191 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  29.01 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  23.48 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  21.58 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  24.29 
 
 
150 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  24.07 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  19.23 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>