20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2894 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  100 
 
 
187 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  77.72 
 
 
185 aa  304  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  24.84 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  28.9 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  21.79 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  26.32 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  24.54 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  28.33 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  23.38 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  27.65 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  21.55 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  22.46 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  24.34 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  22.29 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  24.79 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  25 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  22.15 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  21.95 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  22.79 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>