26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0791 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  63.64 
 
 
188 aa  226  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  61.9 
 
 
180 aa  221  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  52.66 
 
 
185 aa  191  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  53.16 
 
 
187 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  46.33 
 
 
186 aa  167  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  44.1 
 
 
186 aa  153  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 
216 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  41.46 
 
 
218 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  32.96 
 
 
202 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  29.69 
 
 
204 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  30.08 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  29.46 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  25.17 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  24.65 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  24.48 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  29.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  27.41 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  25.58 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  30.47 
 
 
224 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  22.92 
 
 
180 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  26.02 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  23.42 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  22.15 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>