16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0376 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  41.57 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2946  cyclase/dehydrase  33.95 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2266  hypothetical protein  30.2 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  29.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  29.2 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  30.47 
 
 		 175 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  25.5 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  29.01 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  24.52 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  24.68 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  27.19 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  21.77 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  24.82 
 
 		 218 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>