19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0654 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  40.11 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  29.09 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2266  hypothetical protein  25.9 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  32.48 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2946  cyclase/dehydrase  27.45 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  23.42 
 
 		 175 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  25.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  25.48 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2727  hypothetical protein  23.23 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  23.97 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  23.62 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  23.2 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  21.37 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2753  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.99 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>