34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0789 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  59.51 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  47.49 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  46.33 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  44.05 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  48.45 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  43.37 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  32.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  34.38 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0654  Polyketide cyclase/dehydrase  29.09 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.350686  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0376  cyclase/dehydrase  29.79 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  29.03 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  27.01 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2894  cyclase/dehydrase  22.46 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470479 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  22.06 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2313  cyclase/dehydrase  21.59 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  20.71 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  21.32 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  19.48 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  25.54 
 
 		 322 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  23.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2212  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0350  cyclase/dehydrase  22.6 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  29.7 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  28.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  20.66 
 
 		 504 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  26.72 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>