25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1087 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1087  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11831  hypothetical protein  93.1 
 
 
178 aa  333  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11821  hypothetical protein  90.86 
 
 
180 aa  328  3e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11661  hypothetical protein  88.51 
 
 
179 aa  319  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11121  hypothetical protein  56.69 
 
 
173 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.892895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1916  hypothetical protein  54.32 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.973334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0750  hypothetical protein  52.56 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09421  hypothetical protein  48.82 
 
 
195 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0763322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0982  hypothetical protein  35.81 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.499344  normal  0.101871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  34.57 
 
 
191 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  32.26 
 
 
202 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37532  predicted protein  26.34 
 
 
322 aa  68.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0687  cyclase/dehydrase  26 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.556029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  25.33 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  26.14 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31407  predicted protein  22.57 
 
 
504 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0548  hypothetical protein  23.63 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0791  cyclase/dehydrase  24.48 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  23.53 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  22.56 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0790  cyclase/dehydrase  26.04 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  23.87 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2052  cyclase/dehydrase  24.44 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.43857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  19.48 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1874  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>