16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1806 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1697  cyclase/dehydrase  77.93 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2552  cyclase/dehydrase  22.76 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00196411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  29.13 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3614  cyclase/dehydrase  25.97 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5760  cyclase/dehydrase  24.68 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1930  cyclase/dehydrase  23.29 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  25.77 
 
 		 163 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  26.09 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  22.7 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  34.62 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  21.28 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  22.73 
 
 		 182 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>