163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0340 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0340  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 148 aa  285  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  31.97 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  29.2 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3228  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  27.54 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  26.23 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  24.09 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  28.69 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  25.81 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  24.82 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  26.35 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  27.05 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  27.05 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  28.18 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  30.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  29.09 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  23.36 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  30.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  26.23 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  25.41 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  27.36 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  28.71 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  27.36 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  24.82 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  27.78 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  24.82 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  28.95 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  24.82 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  26.98 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  25.55 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  26.23 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  24.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  27.72 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  25.74 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  24.59 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  27.72 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  25.74 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  25.4 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  25.41 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  26.47 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  27.72 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  25.2 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  25.4 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  22.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  31.86 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  28.99 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  24.6 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  23.01 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  29.5 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>